O Biotério é destinado à manutenção de pequenos ruminantes (caprinos e ovinos) animais destinados ao ensino, pesquisa e extensão. A UniPECO está localizada em um galpão pré-moldado com uma área total de 200m². Este conta com 100m² de baias com piso ripado e suspenso, divididas em quatro baias de 25m² cada, podendo ser divididas dependendo da necessidade do experimento. Este galpão conta com vestiários (masculino e feminino); depósito de ração e sal mineral; baia de enfermaria, sala para realização de ultrassonografia e uma suíte para apoio aos pesquisadores e alunos de pós-graduação. Todas as instalações da UniPECO são monitoradas por câmeras mantidas pela Universidade.